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由发生变异的芽长成枝条或植株， 通过鉴定选择获得新品种的方法。这种方法大多是在原品种优良综合性状的基础上， 从个别或少数性状发生的突变中， 选择某种性状更为优异的类型。果树中有许多著名的优良品种来自芽变， 美国在20世纪初叶从元帅品种中选出了芽变品种红冠和红星; 50年代初从红星芽变中选出了新红星; 70年代以来， 又选出许多红色、短枝型的元帅系芽变新品种。温州蜜柑的芽变选种也是较成功的实例。1909年前， 日本已栽培有尾张等几个温州蜜柑的品种， 以后在一株尾张树上发现一个芽变枝， 定名为早熟樋口; 20世纪60年代在尾张中选出早熟的松山和宫川等芽变品种。

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