明英宗正统十一年（1446年）十二月，陕西甘州（治所在今甘肃张掖市）等地发生瘟疫，明朝政府遣右通政王锡，祭西岳华山、西镇吴山（在今陕西陇县西南）之神。太常寺丞李宗周祭甘肃境内山川之神。（《明英宗实录》卷148）祈求神灵保佑，消除灾害。明朝自太祖朱元璋开始，从国都到各府县，建设规模宏敞的城隍庙，也是出于同样的功利考虑。
4 对防疫工作的探索
有瘟疫必然就有同瘟疫的斗争。历史上每一次瘟疫过后，都会引起社会各界的反思。最为积极的是加强了人们对医药的研究，促进治疗验方的形成和利用。
《周礼》记载了周王室定期举行“以索室驱疫”的时傩活动以及负责“四时变国火，以救时疫”的官员。《周易》一书出现了后世常用的“豫（预）防”一词。用药物来干预疫病的做法也开始出现，《山海经》载有薰草等7种药物。
汉武帝天汉二年（前99年），月支国（在今阿姆河上游）进贡物中有三枚神香，状如燕卵，大如囊。当时汉朝正在流行瘟疫，使者请烧香一枚以辟疫气，结果“病者皆起”。文献记载中还说，它“香闻百里，积月不歇”。（《甘肃通志》卷50）
东汉建安（196－220年）以来，南阳郡（今河南南阳市）人张仲景，家族二百余口，未及十年，“死者三之二，而伤寒居其七”，仲景乃下决心研究医学，著成中医经典《伤寒杂病论》一书，被后世奉为“医圣”。伤寒是一切外感病的总称，包括“瘟疫”在内。在此书的启发带动下，甘肃历代也出现不少研究医学包括瘟疫的医家和著作。最著名的有魏晋时期安定郡（治临泾县，在今甘肃镇原县东南）人皇甫谧整理编撰成的《针灸甲乙经》。它是将《黄帝内经》，包括《针经》《素问》及《明堂孔穴针灸治要》三部书加以整理，删削、钩玄、疏证，在阐发三部医经的基础上，从中清理、概括、提炼出一套针灸学名词、概念、病状、治则以及穴位、针刺的理论技巧。《针灸甲乙经》既吸收传统阴阳五行学说的合理成分，又摆脱巫术、方士的迷信束缚，使中医针灸学变成一门实践性、经验性，并带有一定科学性的医疗技术，其中包括治疗瘟疫的针刺疗法。